L’histoire de Flourens est mal ou peu connue.
Les vestiges les plus anciens, briques et débris de poteries, trouvés dans les années 1960 par l’abbé Baccrabère, attestent d'une présence gallo-romaine.
Les fouilles préventives des nouveaux lotissements, débutées en 2003, ont mis à jour des silos, un four à tuile et des souterrains datant du Moyen âge.
Sous l'ancien régime, Flourens faisait partie de la viguerie de Toulouse, comme Péchauriolle, commune qui a fusionné avec Flourens par ordonnance du 5 Septembre 1847.
Une source d'eau ferrugineuse a été exploitée au XIX ème siècle pour ses propriétés médicinales.
Flourens a toujours été une commune agricole
Au XVI ème siècle, la culture du pastel, « l’or bleu », a fait la richesse de Flourens et de Toulouse. A Lancefoc, le cadastre prouve l’ existence de terres appartenant au pastelier Lancefoc; à proximité, le lieu-dit « Molin » correspondrait à la présence d’un moulin pastelier.
Au XVII ème siècle, 4 moulins à vent pour le froment fonctionnaient grâce aux vents dominants, l’autan et le cers.
Dans les années 1960, de nombreuses vignes étaient cultivées sur la commune; il n’en reste plus qu’une aujourd’hui.
La présentation du patrimoine de Flourens est accessible sur BienvenueFlourens
